Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Xrcc3Q9CXE6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Xrcc3Q9CXE6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Xrcc3Q9CXE6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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