Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxxc1Q9CWW7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxxc1Q9CWW7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms