Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rhobtb3Q9CTN4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rhobtb3Q9CTN4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rhobtb3Q9CTN4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rhobtb3Q9CTN4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rhobtb3Q9CTN4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rhobtb3Q9CTN4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rhobtb3Q9CTN4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rhobtb3Q9CTN4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rhobtb3Q9CTN4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rhobtb3Q9CTN4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rhobtb3Q9CTN4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rhobtb3Q9CTN4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rhobtb3Q9CTN4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rhobtb3Q9CTN4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Rhobtb3Q9CTN4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rhobtb3Q9CTN4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms