Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRC3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRC3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRC3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRC3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CRC3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CRC3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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