Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkiras2Q9CR56 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkiras2Q9CR56 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms