Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhl28Q9CR40 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms