Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR14

Fancl, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanclQ9CR14 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FanclQ9CR14 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FanclQ9CR14 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FanclQ9CR14 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FanclQ9CR14 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FanclQ9CR14 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FanclQ9CR14 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FanclQ9CR14 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FanclQ9CR14 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FanclQ9CR14 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FanclQ9CR14 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FanclQ9CR14 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FanclQ9CR14 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FanclQ9CR14 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FanclQ9CR14 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FanclQ9CR14 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FanclQ9CR14 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FanclQ9CR14 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FanclQ9CR14 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FanclQ9CR14 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FanclQ9CR14 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FanclQ9CR14 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms