Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nipsnap3bQ9CQE1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms