Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acss1Q99NB1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acss1Q99NB1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acss1Q99NB1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acss1Q99NB1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss1Q99NB1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms