Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac9Q99N13 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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