Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SrrtQ99MR6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.7 ms