Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Atp1b4Q99ME6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms