Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cstf3Q99LI7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms