Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pagr1aQ99L02 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms