Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clint1Q99KN9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clint1Q99KN9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms