Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lims1Q99JW4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms