Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Def8Q99J78 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Def8Q99J78 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms