Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim59Q922Y2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim59Q922Y2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms