Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
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Sh3bp4Q921I6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Sh3bp4Q921I6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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