Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smarca5Q91ZW3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca5Q91ZW3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms