Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIK3

H1foo, Histone H1oo, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1fooQ8VIK3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H1fooQ8VIK3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H1fooQ8VIK3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms