Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crb1Q8VHS2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Crb1Q8VHS2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms