Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc71Q8VEG0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc71Q8VEG0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms