Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Fyco1Q8VDC1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms