Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms