Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sumf1Q8R0F3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sumf1Q8R0F3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sumf1Q8R0F3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms