Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms