Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OptnQ8K3K8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms