Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vrk3Q8K3G5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vrk3Q8K3G5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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