Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms