Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms