Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccm2Q8K2Y9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms