Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZU6

Pxdc1, PX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pxdc1Q8JZU6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pxdc1Q8JZU6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pxdc1Q8JZU6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms