Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ep400Q8CHI8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms