Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH77

Nav1, Neuron navigator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nav1Q8CH77 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nav1Q8CH77 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms