Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brf1Q8CFK2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms