Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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