Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup88Q8CEC0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup88Q8CEC0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup88Q8CEC0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup88Q8CEC0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup88Q8CEC0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup88Q8CEC0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup88Q8CEC0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup88Q8CEC0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup88Q8CEC0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup88Q8CEC0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup88Q8CEC0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup88Q8CEC0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup88Q8CEC0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.5 ms