Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc17Q8CE13 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc17Q8CE13 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms