Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nrip1Q8CBD1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms