Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slfn5Q8CBA2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slfn5Q8CBA2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms