Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nhsl1Q8CAF4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nhsl1Q8CAF4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms