Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
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Usp44Q8C2S0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp44Q8C2S0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp44Q8C2S0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp44Q8C2S0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp44Q8C2S0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp44Q8C2S0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp44Q8C2S0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp44Q8C2S0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp44Q8C2S0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp44Q8C2S0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp44Q8C2S0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp44Q8C2S0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Usp44Q8C2S0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Usp44Q8C2S0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Usp44Q8C2S0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
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Usp44Q8C2S0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Usp44Q8C2S0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
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Usp44Q8C2S0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Usp44Q8C2S0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Usp44Q8C2S0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Usp44Q8C2S0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Usp44Q8C2S0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp44Q8C2S0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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