Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYH8

Chd9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 2,885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd9Q8BYH8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd9Q8BYH8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms