Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms