Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skor1Q8BX46 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skor1Q8BX46 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms