Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp54Q8BL06 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms