Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.6 ms