Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnrc6bQ8BKI2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms