Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rufy1Q8BIJ7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rufy1Q8BIJ7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms